Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYCNP04198 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYCNP04198 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYCNP04198 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYCNP04198 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYCNP04198 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYCNP04198 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYCNP04198 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYCNP04198 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYCNP04198 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYCNP04198 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYCNP04198 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYCNP04198 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYCNP04198 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYCNP04198 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYCNP04198 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYCNP04198 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYCNP04198 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYCNP04198 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYCNP04198 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYCNP04198 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYCNP04198 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYCNP04198 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYCNP04198 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms