Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNTO95613 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCNTO95613 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCNTO95613 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCNTO95613 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNTO95613 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNTO95613 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNTO95613 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNTO95613 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNTO95613 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNTO95613 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNTO95613 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNTO95613 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNTO95613 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNTO95613 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNTO95613 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNTO95613 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNTO95613 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNTO95613 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNTO95613 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNTO95613 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNTO95613 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNTO95613 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNTO95613 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCNTO95613 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCNTO95613 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCNTO95613 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNTO95613 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNTO95613 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms