Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIX6O95475 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX6O95475 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX6O95475 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX6O95475 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX6O95475 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX6O95475 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX6O95475 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX6O95475 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX6O95475 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX6O95475 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX6O95475 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIX6O95475 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIX6O95475 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX6O95475 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX6O95475 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX6O95475 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX6O95475 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX6O95475 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX6O95475 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX6O95475 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX6O95475 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms