Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms