Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM1O75626 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM1O75626 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms