Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms