Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF40O75150 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF40O75150 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF40O75150 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF40O75150 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF40O75150 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF40O75150 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF40O75150 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF40O75150 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF40O75150 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF40O75150 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF40O75150 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF40O75150 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF40O75150 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF40O75150 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF40O75150 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF40O75150 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms