Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB2O43741 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms