Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA3O43365 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.4 ms