Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1CO15160 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms