Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WNT9AO14904 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT9AO14904 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms