Protein–RNA interactions for Protein: O00444

PLK4, Serine/threonine-protein kinase PLK4, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLK4O00444 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLK4O00444 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLK4O00444 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLK4O00444 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLK4O00444 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLK4O00444 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLK4O00444 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLK4O00444 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLK4O00444 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLK4O00444 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLK4O00444 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLK4O00444 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLK4O00444 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLK4O00444 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms