Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
O00370 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
O00370 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
O00370 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
O00370 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
O00370 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
O00370 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
O00370 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
O00370 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
O00370 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
O00370 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
O00370 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
O00370 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
O00370 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
O00370 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
O00370 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
O00370 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
O00370 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
O00370 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
O00370 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
O00370 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
O00370 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.5 ms