Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QR89 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QR89 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QR89 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QR89 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QR89 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QR89 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QR89 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QR89 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QR89 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QR89 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QR89 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms