Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYSRT1A8MQ03 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms