Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms