Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CBY3A6NI87 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms