Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POTEMA6NI47 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POTEMA6NI47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms