Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms