Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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