Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NIPSNAP2O75323 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NIPSNAP2O75323 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms