Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC099344.2-201ENST00000430897 1061 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC005076.1-201ENST00000433446 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 HNRNPA1P8-201ENST00000436090 951 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RPS29P62273 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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