Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A4-201ENST00000357336 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms