Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCG3Q8WXD2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCG3Q8WXD2 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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