Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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