Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9Y3F1 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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