Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PHBP5-201ENST00000449310 768 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC073188.5-201ENST00000451103 673 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ZCRB1-205ENST00000552673 907 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ZNF548-209ENST00000598895 571 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CNTF-201ENST00000361987 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 VAMP8-201ENST00000263864 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 GAGE10-201ENST00000407599 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL935212.2-201ENST00000419207 718 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MAPT-207ENST00000420682 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MAPT-208ENST00000431008 1233 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL138902.1-201ENST00000437965 856 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC112492.3-201ENST00000457557 1031 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC245164.1-201ENST00000517731 412 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SELENOS-207ENST00000531964 764 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL589743.2-201ENST00000547821 602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 C12orf73-205ENST00000547945 463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 RN7SL336P-201ENST00000580171 297 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FAM236C-201ENST00000636267 463 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL109618.1-201ENST00000434910 1683 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CLK4-208ENST00000520957 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 IGLV1-40-201ENST00000390299 407 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CHCHD4P4-201ENST00000437690 327 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FCGR2C-202ENST00000466542 1070 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ATP6V0CP1-201ENST00000482495 618 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AP001266.1-201ENST00000531155 1044 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTPRMP28827 MT3-206ENST00000570176 579 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.51-201ENST00000570437 272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AP002478.2-201ENST00000584060 557 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC092329.1-201ENST00000594653 574 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PTPRMP28827 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 EPC2-203ENST00000409654 1624 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 NAALAD2-202ENST00000375944 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CCDC148-203ENST00000409889 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AL590302.2-201ENST00000435810 1122 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 DANT1-202ENST00000451869 444 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 RN7SL150P-201ENST00000462298 262 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC079804.3-201ENST00000508367 1000 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 DHDDS-216ENST00000525682 1235 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 FAU-206ENST00000529259 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MYCT1-202ENST00000529453 724 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC007540.1-201ENST00000548473 507 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ARL1-209ENST00000551671 879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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