Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POMPQ9Y244 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POMPQ9Y244 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POMPQ9Y244 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms