Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN8AQ9UQD0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms