Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms