Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPN3Q9UHW5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms