Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGFRNQ9P2B2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGFRNQ9P2B2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms