Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RCC2Q9P258 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RCC2Q9P258 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms