Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNT4Q9P109 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT4Q9P109 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms