Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM9Q9P0T7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM9Q9P0T7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms