Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMPD3Q9NY59 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPD3Q9NY59 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms