Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM248Q9NWD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM248Q9NWD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms