Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCP11L1Q9NUJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms