Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 PCMTD1-205ENST00000521046 856 ntTSL 214.18□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 TBL3-201ENST00000332704 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.032e-15■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 TBL3-206ENST00000569628 2594 ntTSL 214.4□□□□□ -0.12e-15■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 FBXO22-207ENST00000569022 2164 ntTSL 1 (best)15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 FBXO22-208ENST00000569054 782 ntTSL 514.68□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 FBXO22-205ENST00000565036 725 ntTSL 513.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 FBXO22-209ENST00000569749 1496 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-226ENST00000494621 871 ntTSL 314.34□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-206ENST00000437658 931 ntTSL 212.89□□□□□ -0.358e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-213ENST00000466330 746 ntTSL 311.56□□□□□ -0.568e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-216ENST00000475743 590 ntTSL 411.2□□□□□ -0.628e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-212ENST00000464375 626 ntTSL 311.11□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-214ENST00000466975 560 ntTSL 410.4□□□□□ -0.748e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-205ENST00000417778 760 ntTSL 310.31□□□□□ -0.768e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-209ENST00000455226 585 ntTSL 49.29□□□□□ -0.928e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-208ENST00000454278 595 ntTSL 49.25□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-207ENST00000454122 731 ntTSL 39□□□□□ -0.978e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-220ENST00000487707 592 ntTSL 38.87□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.543e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 NMT2-201ENST00000378150 2457 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 27.5
EXOSC5Q9NQT4 EPC2-202ENST00000397424 672 ntTSL 315.27■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 27.4
EXOSC5Q9NQT4 EPC2-205ENST00000457184 724 ntTSL 514.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 27.4
EXOSC5Q9NQT4 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 27.4
EXOSC5Q9NQT4 KCMF1-204ENST00000456682 661 ntTSL 321.07■□□□□ 0.968e-8■■■■■ 27.4
EXOSC5Q9NQT4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 27.4
EXOSC5Q9NQT4 KCMF1-202ENST00000428691 560 ntTSL 214.5□□□□□ -0.098e-8■■■■■ 27.4
EXOSC5Q9NQT4 KCMF1-203ENST00000453448 625 ntTSL 34.89□□□□□ -1.638e-8■■■■■ 27.4
EXOSC5Q9NQT4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM172A-202ENST00000502503 1392 ntTSL 27.94□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.457e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 SGMS1-204ENST00000492601 625 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)4.54□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 39.26□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 27.3
EXOSC5Q9NQT4 ATP13A3-205ENST00000457986 490 ntTSL 319.17■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.814e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 PPIG-203ENST00000414307 1062 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 PPIG-211ENST00000530152 690 ntTSL 38.34□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 PPIG-206ENST00000433207 1485 ntTSL 1 (best)4.43□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 PPIG-204ENST00000417938 527 ntTSL 53.57□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC8-207ENST00000580104 5014 ntTSL 212.38□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC8-211ENST00000582539 4391 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC8-203ENST00000577474 862 ntTSL 44.89□□□□□ -1.634e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 BMT2-202ENST00000432572 1271 ntTSL 56.49□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 BMT2-203ENST00000485446 528 ntTSL 52.16□□□□□ -2.061e-6■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 ZZZ3-210ENST00000476275 4737 ntTSL 24.91□□□□□ -1.624e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.714e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 ZZZ3-211ENST00000481346 4500 ntTSL 1 (best)3.19□□□□□ -1.94e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RPS15A-211ENST00000575669 3828 nt6.6□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RREB1-205ENST00000467782 243 ntTSL 512.5□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RREB1-206ENST00000471433 1021 ntTSL 511.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 511.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 27.2
EXOSC5Q9NQT4 CEP350-210ENST00000491495 1059 ntTSL 515.69■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-205ENST00000536442 1301 ntTSL 514.63□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-211ENST00000540794 518 ntTSL 33.52□□□□□ -1.856e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-204ENST00000536154 549 ntTSL 42.19□□□□□ -2.066e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 NIPBL-204ENST00000504430 3455 ntTSL 25.4□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.243e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 LINC01184-208ENST00000514409 494 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 SUN1-209ENST00000424128 633 ntTSL 514.11□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 SUN1-216ENST00000440380 537 ntTSL 514.07□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 27.1
EXOSC5Q9NQT4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 27.1
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 177.2 ms