Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSU72Q9NP77 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSU72Q9NP77 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms