Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREBQ9HCU5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREBQ9HCU5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms