Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EPB41L5Q9HCM4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB41L5Q9HCM4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms