Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAT1LQ9HCJ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAT1LQ9HCJ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms