Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPERBQ9H7T0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms