Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTR3CQ9C0K3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR3CQ9C0K3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms