Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms