Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf16Q9BUW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf16Q9BUW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms