Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC50A1Q9BRV3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC50A1Q9BRV3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms