Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ4

C11orf70, Uncharacterized protein C11orf70, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf70Q9BRQ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf70Q9BRQ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf70Q9BRQ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms