Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.249e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.249e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPP5C-210ENST00000493347 431 ntTSL 316.54■□□□□ 0.243e-15■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.239e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHM1-215ENST00000586562 550 ntTSL 516.47■□□□□ 0.239e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.219e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.219e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPFIA3-206ENST00000602655 3493 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.29e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PIK3R2-204ENST00000464016 588 ntTSL 316.29■□□□□ 0.29e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.29e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TNNI2-205ENST00000468473 435 ntTSL 316.27■□□□□ 0.29e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.199e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.199e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SMYD5-203ENST00000413491 660 ntTSL 416.23■□□□□ 0.199e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ATP13A1-210ENST00000491221 937 ntTSL 216.21■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.199e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SH3BP4-205ENST00000444916 570 ntTSL 416.2■□□□□ 0.189e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.179e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NTHL1-202ENST00000561841 1052 ntTSL 515.96■□□□□ 0.159e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.139e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ARMC9-203ENST00000428662 1050 ntTSL 515.84■□□□□ 0.139e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.129e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DNM1L-225ENST00000551076 556 ntTSL 415.73■□□□□ 0.119e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.119e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.119e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.119e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.119e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 KRT8-212ENST00000549198 592 ntTSL 215.7■□□□□ 0.19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 VPS33B-206ENST00000557358 561 ntTSL 415.67■□□□□ 0.19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 VPS33B-205ENST00000556096 1731 ntTSL 215.67■□□□□ 0.17e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.099e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF100-205ENST00000598026 588 ntTSL 415.59■□□□□ 0.098e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.089e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.079e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.069e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 L3MBTL2-208ENST00000481902 2432 ntTSL 215.42■□□□□ 0.069e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 KRT8-214ENST00000551318 507 ntTSL 215.41■□□□□ 0.069e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.059e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 STK11IP-210ENST00000475396 2251 ntTSL 215.34■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.049e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.038e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 215.21■□□□□ 0.033e-15■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.019e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 M6PR-206ENST00000541507 2198 ntTSL 515.12■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 AC005154.1-224ENST00000582733 521 ntTSL 415.08■□□□□ 09e-9■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.019e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CHD3-206ENST00000452447 1573 ntTSL 514.95□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MGAT4B-219ENST00000522293 759 ntTSL 314.95□□□□□ -0.029e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRIM52-204ENST00000514805 1727 ntTSL 314.95□□□□□ -0.029e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SCYL2-207ENST00000549687 2328 ntTSL 214.93□□□□□ -0.029e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PGF-205ENST00000555253 3549 ntTSL 214.92□□□□□ -0.029e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.039e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 HDAC1-209ENST00000484305 561 ntTSL 514.8□□□□□ -0.049e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 STK11IP-205ENST00000459692 854 ntTSL 514.67□□□□□ -0.069e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.079e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.089e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.089e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-208ENST00000591971 836 ntTSL 514.52□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.099e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ATF3-208ENST00000465155 1626 ntTSL 214.42□□□□□ -0.19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PCBP2-225ENST00000553064 1786 ntTSL 514.42□□□□□ -0.11e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.119e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TROAP-212ENST00000550346 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.119e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.129e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHM1-212ENST00000584420 603 ntTSL 414.33□□□□□ -0.129e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 M6PR-209ENST00000543704 616 ntTSL 314.28□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHM1-207ENST00000581448 3292 ntTSL 1 (best)14.25□□□□□ -0.139e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ITPR1-207ENST00000467056 1483 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.139e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 AAK1-207ENST00000489327 1432 ntTSL 514.18□□□□□ -0.149e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FBXW4-205ENST00000489578 483 ntTSL 214.08□□□□□ -0.169e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.169e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RAB2B-205ENST00000485996 443 ntTSL 213.99□□□□□ -0.179e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APH1A-205ENST00000461320 1038 ntTSL 313.99□□□□□ -0.179e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 HDAC4-202ENST00000430200 578 ntTSL 313.8□□□□□ -0.29e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.229e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHM1-204ENST00000579197 4995 ntTSL 213.7□□□□□ -0.229e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRIM52-206ENST00000612671 4753 nt13.65□□□□□ -0.229e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SEC14L1-203ENST00000431431 2504 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NAXE-204ENST00000467374 779 ntTSL 213.55□□□□□ -0.249e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-207ENST00000590407 1770 ntTSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.245e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.259e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RHBDF1-211ENST00000493647 935 ntTSL 313.35□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 627.6 ms